1. Od dnia 27.06.2014 r. Zespół Audytu i Kontroli Urzędu Miasta Bydgoszczy prowadzi kontrolę w  Urzędzie Miasta Bydgoszczy w zakresie prawidłowości i terminowości udokumentowania obrotu składnikami majątku Miasta Bydgoszczy w związku  z realizacją wybranych zadań  ze szczególnym uwzględnieniem  lat 2011- 2013 (kontrola zawieszona).

2. W dniu 09.03.2022r. z upoważnienia Wojewody Kujawsko – Pomorskiego została przeprowadzona kontrola zadań Miasta w zakresie przeciwdziałania przemocy w rodzinie – Zespół Interdyscyplinarny.

3. Od dnia 11.04.2022r. Urząd Marszałkowski Województwa Kujawsko – Pomorskiego w Toruniu prowadzi kontrolę planową projektu nr RPKP.10.01.02-04-0002/20 pt. „Edu(R)Ewolucja 2”.

4. W dniu 14.07.2022r. Wojewódzki Urząd Ochrony Zabytków w Toruniu przeprowadził kontrolę pracy Miejskiego Konserwatora Zabytków w Bydgoszczy. Kontrolą objęto okres od 01.01.2021r. do 31.12.2021r.

5. Od dnia 01.09.2022r. Izba Administracji Skarbowej w Bydgoszczy prowadzi audyt projektu nr RPKP.10.02.03-04-0008/18 pn. „Dzisiaj staż, jutro praca”.

6. Od dnia 30.11.2022r. Centrum Projektów Europejskich w Warszawie prowadzi kontrolę planową realizacji projektu nr CE1578 pn. „City Water Circles: Urban Cooperation Models for enhancing water efficiency and reuse in Central European functional urban areas with an integrated circular economy approach” (CWC), realizowanego w ramach Programu Interreg Central Europe 2014-2020.

7. Od dnia 19.01.2023r. Najwyższa Izba Kontroli Delegatura NIK w Bydgoszczy prowadzi kontrolę pt. „Obsługa obywateli polskich i cudzoziemców w jednostkach administracji publicznej”.